CGI

1. Можно, если тебе удасться запустить юниксовый компилятор.

2. Еще как различаются, даже у одного и того-же Юникса/Линукса, но разных версий, ELFы (тамошние EXEшники) могут быть разного формата.

А нет ли какого *nix копилятора работающего под Windows?
Или какого-нибудь эмулятора?

Есть WMWare, но это не совсем того эмулятор. А наоборот есть. А под виндой такими вещами не занимаются.

Ставить *nix придется все равно.