клонирование машины

немного неясен смысл вопроса.
нужна виртуальная машина с теми же параметрами, что и физическая? - настроить виртуалку максимально возможно ближе к реальной. Смотря какая виртуалка.

В общем, поясни.

ситуация такова: делается копия физической машины, с нее снимается жесткий диск, на этот жесткий диск устанавливается ОС (уже на другом компютере)

мне нужна виртуальная машина с параметрами наиболее приближенными к физичекой

Наиболее приближенной будет аппаратная виртуализация с XEN, но один большой недостаток - нужен мощный процессор с поддержкой контроллера виртуализации, сам понимаешь, это самые последние двухядерные процессоры.
Может я не совсем понял твой вопросс, но могу описать как под FreeBSD клонировать систему и запустить в jail окружении (допустим на втором диске), но соответственно понадобиться искомая система для запуска.
А вообще необязательно перетаскивать диски туда-сюда, возможно же клонировать систему по сети (если архитектуры соответственно одинаковые).