При линковании с ключом /DEBUG (Generate Debug Info) - генерируется этот самый PDB, и его имя прописывается в полученный экзешник вместе с полным путем.
Как можно сделать, чтобы полный путь не прописывался, а добавлялось только имя файла PDB? В родных майкросовтовских библиотеках (например kernel32.dll, user32.dll) - там только имя файла PDB, без полного пути...